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欧罗巴联赛分为资格赛阶段、附加赛阶段和正赛阶段三部分，正赛阶段由联赛阶段、淘汰赛及决赛组成。联赛阶段共有36队参加，分为4档，每档9队，每支球队将与4个分档中分别随机抽取的2队各进行一场比赛，主客场由抽签决定。积分前8名直接进入16强，积分第9-24名球队进行淘美足球网汰赛附加赛，主客场两回合比赛优胜者进入16强。1/8决赛、1/4决赛和半决赛为主客场两回合比赛，决赛在中立场地进行，不设三四名比赛。对阵双方若在90分钟常规时间结束后打平会进入30分钟加时赛，加时赛仍未分胜负则进入点球大战，欧联冠军可获得次赛季欧洲冠军联赛正赛资格。

20世纪80年代中后期，诸多事件已清楚预示着职业足球需要进行一场本质性的改革。 1985年5月11日，56名球迷在布拉德福德球场的大火中丧生。5月29日，在比利时布鲁塞尔的海瑟尔球场，1984/85赛季欧洲冠军俱乐部杯（欧洲冠军联赛前身）决赛利物浦对尤文图斯的比赛更是酿成了著名的海瑟尔惨案——不同球队的支持者之间发生暴力事件，结果导致39名球迷死亡——英格兰俱乐部更是因此被欧洲足球协会联盟禁止参加欧洲赛事达5年之久。1989年又发生了一次足球惨剧，英格兰足总杯半决赛（美足球网利物浦-诺丁汉森林）在谢菲尔德周三的希尔斯堡球场举行，由于人数拥挤造成看台坍塌，结果96名球迷死亡，150多人受伤。

2008年9月26日，欧足联执委会决定从2009/10赛季起，欧洲联盟杯更名为欧足联欧罗巴联赛并对赛制进行改革。最大的改变是小组赛将由48队参加，分成12小组，每组4队进行主客循环赛，每组前两名（共 24 队）将联同欧冠小组赛第三名总共 32 队晋级淘汰赛。2013年5月欧足联决定，2015/16赛季起欧洲联赛的卫冕冠军将会参加下赛季欧冠联赛附加赛；若欧冠卫冕冠军国内联赛成绩已经保证其获得欧冠小组赛资格，欧联卫冕冠军将直接参加小组赛。此外，此次改革后直接晋级欧洲联赛小组赛的球队将增至16支。 2018/19赛季起，欧洲联赛的卫冕冠军将直接参加欧冠小组赛。2020/21赛季起，欧洲联赛小组赛球队缩编为32队，8个小组第一直接参加1/8决赛，8个小组第二将与8个欧冠小组第三进行附加赛优胜者进美足球网入16强。 此外，欧洲联赛的8个小组第三将与新成立的欧洲足联协会联赛（以下简称：欧协联）进行附加赛，优胜者可以留在欧洲赛场参加欧协联1/8决赛。

北京时间2021年6月24日，美足球网欧足联官方宣布，从2021/22赛季开始，取消现行欧战客场进球规则。 2023/24赛季欧联资格赛将首次引入VAR技术，从第三轮开始使用；2024/25赛季开始VAR技术将从欧联资格赛第一轮启用。 2024/25赛季起，欧联正赛参赛球队从32支增加到36支，赛制与欧冠联赛近似。